عوامل زیر از علل بروز ناهنجاری دندانی هستند:

• عوامل ژنتیك

• عادات

• پوسیدگی و از دست‌دادن دندان‌های شیری زودتر از موعد

• عدم ‌هماهنگی اندازه دندان‌ها با اندازه فك

• ضربه

• كمبود فضا

• رویش دندان‌های عقل

• بیماری‌های لثه

• بعضی از بیماری‌های بافت نرم و استخوان

• تنفس دهانی ناشی از كیپ‌بودن بینی 

• رژیم‌های غذایی

 در كنار این عوامل، عادات غلط در حیطه دهان مانند عادت مكیدن انگشت، جویدن ناخن یا مداد از جمله شایع‌ترین عوامل است. در این حالت فرد به‌طور ناخودآگاه دندان‌های پایینی را با انگشت شست خود به سمت عقب و دندان‌های بالایی را به سمت جلو هل می‌دهد. این روند در صورتی كه تا سن 4 سالگی ادامه داشته باشد، عادی است اما تداوم آن موجب تغییر شكل و فرم قوس دندان‌ها می‌شود و اگر تا پایان 7-6 سالگی تداوم پیدا كند به مرور موجب تغییر شكل استخوان فك نیز می‌شود. در این حالت فرد به اختلالی مبتلا می‌شود كه فك‌ها در قسمت جلو به‌ هم نمی‌رسند و موقع بلع غذا زبان و گاهی آب دهان بچه بیرون می‌آید. این اختلال درصورتی كه به موقع درمان نشود در بزرگسالی نیز با او باقی می‌ماند. البته فرم صورت و فك افراد هر جامعه‌ای از ژنتیك آن منطقه تبعیت می‌كند. به ‌عنوان مثال در كشور ما داشتن نیمرخ محدب شایعتر از نیمرخ مقعر است. از جمله علل ایجاد چنین شرایطی می‌‌توان به عوامل ارثی، کشیدن زود هنگام دندان‌‌ها و عادات بد دهانی مانند مکیدن انگشت، جویدن ناخن، پیپ، مداد و دیگر اجسام سخت و شکننده اشاره کرد. یکی از عواقب مشکلات ناهنجاری‌های دندانی، دندان قروچه است. در این موارد باید به درمان ناهنجاری و عوامل ایجاد کننده دندان قروچه پرداخت تا از سایش و شکستگی دندان‌‌ها جلوگیری کرد.